{"id":3790,"date":"2022-10-27T05:14:19","date_gmt":"2022-10-27T05:14:19","guid":{"rendered":"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/?page_id=3790"},"modified":"2023-04-13T01:33:34","modified_gmt":"2023-04-12T23:33:34","slug":"klinische-bioinformatik-prof-keller","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/de\/forschung-am-zbi\/forschungsgruppen\/klinische-bioinformatik-prof-keller\/","title":{"rendered":"Klinische Bioinformatik (Prof. Keller)"},"content":{"rendered":"\t\t<div data-elementor-type=\"wp-page\" data-elementor-id=\"3790\" class=\"elementor elementor-3790\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-inner\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-section-wrap\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-e49a973 elementor-section-boxed elementor-section-gap-beside-yes elementor-section-height-default elementor-section-height-default elementor-section-column-vertical-align-stretch elementor-invisible\" data-id=\"e49a973\" data-element_type=\"section\" data-settings=\"{&quot;animation&quot;:&quot;unicampFadeInUp&quot;}\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-extended\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-row\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-bfbf180\" data-id=\"bfbf180\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-column-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-6c0b646 elementor-widget elementor-widget-tm-heading\" data-id=\"6c0b646\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"tm-heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"tm-modern-heading\">\n\t\t\t\n\t\t\t\t\t<div class=\"heading-primary-wrap\">\n\t\t\t<h2 class=\"heading-primary elementor-heading-title\">\u00dcber uns<\/h2>\t\t<\/div>\n\t\t\n\t\t\t\t    <div class=\"heading-divider\"><\/div>\n\t    \n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-ba3a16d elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"ba3a16d\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<style>\/*! 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Die Gruppe ist einerseits in der Grundlagenforschung aktiv, befasst sich aber auch mit dem gezielten Transfer der Ergebnisse in die Praxis. Dazu arbeitet die Klinische Bioinformatik eng mit dem Universit\u00e4tsklinikum des Saarlandes, aber auch mit Universit\u00e4ten \u00fcber das Saarland hinaus, zusammen. Daneben kooperiert die Gruppe auch mit Diagnostik- und Pharmakonzernen, um die Translation der Forschung zu unterst\u00fctzen. \u00a0<\/p><p class=\"rtejustify\">Thematisch wird an den folgenden vier Themen geforscht: Ursachen der genetischen Resistenz von Bakterien zur besseren Therapieselektion, nicht-invasive Biomarker zur Fr\u00fcherkennung von Erkrankungen, verbesserte genetische Tests und integrative systembiologische Fragestellungen.\u00a0<\/p>\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-6de6b87 elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"6de6b87\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-spacer\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-spacer-inner\"><\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-f6184d8 elementor-widget 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elementor-heading-title\">Gruppenleiter<\/h2>\t\t<\/div>\n\t\t\n\t\t\t\t    <div class=\"heading-divider\"><\/div>\n\t    \n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-6f804a2 elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"6f804a2\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-spacer\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-spacer-inner\"><\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-inner-section elementor-element elementor-element-8b156e5 elementor-section-boxed elementor-section-gap-beside-yes elementor-section-height-default elementor-section-height-default elementor-section-column-vertical-align-stretch\" data-id=\"8b156e5\" data-element_type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container 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studierte Bioinformatik an der Universit\u00e4t des Saarlandes (Master of Sciene im Jahr 2005). 2009 schloss er seine Dissertation im Fach Bioinformatik an der Universit\u00e4t des Saarlandes in der Gruppe von Prof. Lenhof ab, bevor er zum Heidelberger Biotech-Unternehmen febit (heute comprehensive biomarker center) wechselte. Bei febit verantwortete Keller die Bioinformatik und das Biomarker Discovery Programm. Anfang 2012 wechselte Keller nach Erlangen zu Siemens Healthcare, einem der weltweit erfolgreichsten Diagnostik-Unternehmen. Dort war Keller als Director Diagnostic Innovation f\u00fcr disruptive Entwicklungen in der IT und Molekular-Diagnostik verantwortlich. Parallel zu der industriellen T\u00e4tigkeit forschte Keller gemeinsam mit der Humangenetik der Universit\u00e4t des Saarlandes bei Prof. Eckart Meese. Seine Habilitation schloss er 2012 ab. Seit Oktober 2013 leitet Keller den Lehrstuhl f\u00fcr Klinische Bioinformatik an der Medizinischen Fakult\u00e4t der Universit\u00e4t des Saarlandes. Parallel ist Keller seit 2014 kooptierter Professor der Informatik an der Universit\u00e4t des Saarlandes. In seiner Karriere hat er \u00fcber 100 wissenschaftliche Fachbeitr\u00e4ge in renommierten \u201epeer-reviewed\u201c Fachzeitschriften ver\u00f6ffentlich und \u00fcber 40 Patente geschrieben.<\/p>\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-e6a314d elementor-section-boxed elementor-section-gap-beside-yes elementor-section-height-default elementor-section-height-default elementor-section-column-vertical-align-stretch elementor-invisible\" data-id=\"e6a314d\" data-element_type=\"section\" data-settings=\"{&quot;animation&quot;:&quot;unicampFadeInUp&quot;}\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-extended\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-row\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-5cfa51a\" data-id=\"5cfa51a\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-column-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-91c5c45 elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"91c5c45\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-spacer\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-spacer-inner\"><\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-6ed8bf4 elementor-widget elementor-widget-tm-heading\" data-id=\"6ed8bf4\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"tm-heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"tm-modern-heading\">\n\t\t\t\n\t\t\t\t\t<div class=\"heading-primary-wrap\">\n\t\t\t<h2 class=\"heading-primary elementor-heading-title\">Unsere Projekte<\/h2>\t\t<\/div>\n\t\t\n\t\t\t\t    <div class=\"heading-divider\"><\/div>\n\t    \n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-fa57620 elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"fa57620\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-spacer\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-spacer-inner\"><\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-ed3ddcf elementor-widget elementor-widget-tm-heading\" data-id=\"ed3ddcf\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"tm-heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"tm-modern-heading\">\n\t\t\t\n\t\t\t\t\t<div class=\"heading-primary-wrap\">\n\t\t\t<h4 class=\"heading-primary elementor-heading-title\">Nicht-invasive Biomarker<\/h4>\t\t<\/div>\n\t\t\n\t\t\t\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-3b077e5 elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"3b077e5\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-spacer\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-spacer-inner\"><\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-inner-section elementor-element elementor-element-98d5489 elementor-section-boxed elementor-section-gap-beside-yes elementor-section-height-default elementor-section-height-default elementor-section-column-vertical-align-stretch\" data-id=\"98d5489\" data-element_type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-extended\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-row\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-50 elementor-inner-column elementor-element elementor-element-ea3b469\" data-id=\"ea3b469\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-column-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-9713afc elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"9713afc\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-text-editor elementor-clearfix\">\n\t\t\t\t<p>Schl\u00fcssel zur Heilung vieler Erkrankungen ist die fr\u00fchzeitige Diagnosestellung. Ein oft zitiertes Beispiel sind Krebserkrankungen. Aber auch f\u00fcr neurologische und kardiovaskul\u00e4re Erkrankungen sind Biomarker essenziell. Seit 10 Jahren forschen wir an neuartigen nicht-invasiven Tests. Dabei folgen wir dem Kernprinzip, viele Marker zu messen, um ihre Aussagekraft zu kombinieren und die Trefferquote zu erh\u00f6hen. Au\u00dferdem werden die Biomarker-Muster in verschiedenen Erkrankungen erhoben und verglichen, um krankheitsspezifische Muster zu finden. Als vielversprechendste Kandidaten werden microRNAs untersucht. Neben Microarrays werden Hochdurchsatz-Sequenzierung und qRT-PCR eingesetzt, um Patienten zu charakterisieren und statistisch auszuwerten.<\/p>\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-cd40616 elementor-hidden-desktop elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"cd40616\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-spacer\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-spacer-inner\"><\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-50 elementor-inner-column elementor-element elementor-element-a572adf\" data-id=\"a572adf\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-column-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap\">\n\t\t\t\t\t\t<div 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Hochdurchsatz-Sequenzierung bietet die M\u00f6glichkeit, viele Gene oder gar gesamte Genome von Patienten und ggf. Familienangeh\u00f6rigen zu entschl\u00fcsseln. Eine Kernherausforderung ist die Entwicklung von standardisierter Software, die in klinischem Kontext eingesetzt werden kann, um \u00c4rzte in der Diagnosestellung zu unterst\u00fctzen. Gemeinsam mit anderen Arbeitsgruppen forschen wir an geeigneten L\u00f6sungen. Das wohl bekannteste Beispiel eines Gesamt-Genoms, das in der Arbeitsgruppe ausgewertet wurde, war das Genom des 5300 Jahre alten \u00d6tzis.<\/p>\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-7909280 elementor-hidden-desktop elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"7909280\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-spacer\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-spacer-inner\"><\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-50 elementor-inner-column elementor-element elementor-element-1d74a4a\" data-id=\"1d74a4a\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-column-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap\">\n\t\t\t\t\t\t<div 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data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-text-editor elementor-clearfix\">\n\t\t\t\t<p>Zur Auswahl der richtigen Therapie bei bakteriellen Infektionen ist es nicht nur wichtig, den Erreger der Infektion, sondern auch dessen Resistenzen gegen Antibiotika zu kennen. Klassische Resistenztests dauern bis zu 3 Tage, in dieser Zeit wird oft falsch therapiert. \u00dcberm\u00e4\u00dfige Gabe von Antibiotika f\u00fchrt zudem zu mehr multi-resistenten Bakterien. Gemeinsam mit Siemens Healthcare erforschen wir genetische Ursachen der Antibiotika-Resistenz. Ziel ist ein Schnelltest, der innerhalb eines Tages Bakterien und Resistenzen erkennt, um so schneller die richtige Therapie zu w\u00e4hlen. Die gewonnenen Erkenntnisse k\u00f6nnen dann eingesetzt werden, um gezielt neue Wirkstoffe zu erforschen.<\/p>\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-4d1b7d2 elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"4d1b7d2\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-spacer\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-spacer-inner\"><\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-4bc7a9e elementor-section-boxed elementor-section-gap-beside-yes elementor-section-height-default elementor-section-height-default elementor-section-column-vertical-align-stretch elementor-invisible\" data-id=\"4bc7a9e\" data-element_type=\"section\" data-settings=\"{&quot;animation&quot;:&quot;unicampFadeInUp&quot;}\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-extended\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-row\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-7adb872\" data-id=\"7adb872\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-column-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-3324b00 elementor-widget elementor-widget-tm-heading\" data-id=\"3324b00\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"tm-heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"tm-modern-heading\">\n\t\t\t\n\t\t\t\t\t<div class=\"heading-primary-wrap\">\n\t\t\t<h4 class=\"heading-primary elementor-heading-title\">System-Biologie<\/h4>\t\t<\/div>\n\t\t\n\t\t\t\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-c9444d0 elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"c9444d0\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-spacer\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-spacer-inner\"><\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-inner-section elementor-element elementor-element-895d90e elementor-section-boxed elementor-section-gap-beside-yes elementor-section-height-default elementor-section-height-default elementor-section-column-vertical-align-stretch\" data-id=\"895d90e\" data-element_type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-extended\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-row\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-50 elementor-inner-column elementor-element elementor-element-8197338\" data-id=\"8197338\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-column-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-ff0597e elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"ff0597e\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-text-editor elementor-clearfix\">\n\t\t\t\t<p>Um pathogene Prozesse besser zu verstehen, ist es wichtig, ein Verst\u00e4ndnis \u00fcber mehrere Komplexit\u00e4tsebenen hinweg zu erlangen. Dazu z\u00e4hlen molekulare Erkenntnisse (die klassischen &#8220;omics&#8221;, wie zum Beispiel Genomics, Proteomics, Epigenomics, miRNOmics, Transcriptomics, Metabolomics), Informationen \u00fcber Zellen (Beispiel histologische Untersuchungen bei Krebs), sowie Daten aus bildgebenden Verfahren wie Ultraschall oder Magnet-Resonanz-Tomographie. Wir befassen uns haupts\u00e4chlich mit der Integration verschiedener molekularer Daten. Dar\u00fcber hinaus arbeiten wir an ersten L\u00f6sungen, die die entsprechenden genetischen Profile mit klassischen bildgebenden Verfahren kombinieren. Ein Kernprojekt ist das Tool GeneTrail2, eines der umfangreichsten Bioinformatik-Werkzeuge zur Analyse von verschiedenen &#8220;omics&#8221;-Datens\u00e4tzen, das wir gemeinsam mit der AG Lenhof entwickeln<\/p>\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-8e35d1e elementor-hidden-desktop elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"8e35d1e\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-spacer\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-spacer-inner\"><\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-50 elementor-inner-column elementor-element elementor-element-838993e\" data-id=\"838993e\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-column-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-c4976f9 elementor-widget elementor-widget-image\" data-id=\"c4976f9\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"image.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-image\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" width=\"721\" height=\"548\" src=\"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-content\/uploads\/2023\/03\/biomarker_network.png\" class=\"attachment-full size-full wp-image-6199\" alt=\"\" srcset=\"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-content\/uploads\/2023\/03\/biomarker_network.png 721w, https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-content\/uploads\/2023\/03\/biomarker_network-300x228.png 300w\" sizes=\"(max-width: 721px) 100vw, 721px\" \/>\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>\u00dcber uns Die Arbeitsgruppe Keller geh\u00f6rt der Medizinischen Fakult\u00e4t der Universit\u00e4t des Saarlandes an; dabei verkn\u00fcpft die Klinische Bioinformatik als Br\u00fcckenprofessur die Forschungsgebiete der Medizin und der Bioinformatik. Die Gruppe ist einerseits in der Grundlagenforschung aktiv, befasst sich aber auch mit dem gezielten Transfer der Ergebnisse in die Praxis. Dazu arbeitet die Klinische Bioinformatik eng mit dem Universit\u00e4tsklinikum des Saarlandes, aber auch mit Universit\u00e4ten \u00fcber das Saarland hinaus, zusammen. Daneben kooperiert die Gruppe auch mit Diagnostik- und Pharmakonzernen, um die Translation der Forschung zu unterst\u00fctzen. \u00a0 Thematisch wird an den folgenden vier Themen geforscht: Ursachen der genetischen Resistenz von Bakterien zur besseren Therapieselektion, nicht-invasive Biomarker zur Fr\u00fcherkennung von Erkrankungen, verbesserte genetische Tests und integrative systembiologische Fragestellungen.\u00a0 Zur Webseite der Gruppe Gruppenleiter Prof. Dr. Andreas Keller Andreas Keller studierte Bioinformatik an der Universit\u00e4t des Saarlandes (Master of Sciene im Jahr 2005). 2009 schloss er seine Dissertation im Fach Bioinformatik an der Universit\u00e4t des Saarlandes in der Gruppe von Prof. Lenhof ab, bevor er zum Heidelberger Biotech-Unternehmen febit (heute comprehensive biomarker center) wechselte. Bei febit verantwortete Keller die Bioinformatik und das Biomarker Discovery Programm. Anfang 2012 wechselte Keller nach Erlangen zu Siemens Healthcare, einem der weltweit erfolgreichsten Diagnostik-Unternehmen. Dort war Keller als Director Diagnostic Innovation f\u00fcr disruptive Entwicklungen in der IT und Molekular-Diagnostik verantwortlich. Parallel zu der industriellen T\u00e4tigkeit forschte Keller gemeinsam mit der Humangenetik der Universit\u00e4t des Saarlandes bei Prof. Eckart Meese. Seine Habilitation schloss er 2012 ab. Seit Oktober 2013 leitet Keller den Lehrstuhl f\u00fcr Klinische Bioinformatik an der Medizinischen Fakult\u00e4t der Universit\u00e4t des Saarlandes. Parallel ist Keller seit 2014 kooptierter Professor der Informatik an der Universit\u00e4t des Saarlandes. In seiner Karriere hat er \u00fcber 100 wissenschaftliche Fachbeitr\u00e4ge in renommierten \u201epeer-reviewed\u201c Fachzeitschriften ver\u00f6ffentlich und \u00fcber 40 Patente geschrieben. Unsere Projekte Nicht-invasive Biomarker Schl\u00fcssel zur Heilung vieler Erkrankungen ist die fr\u00fchzeitige Diagnosestellung. Ein oft zitiertes Beispiel sind Krebserkrankungen. Aber auch f\u00fcr neurologische und kardiovaskul\u00e4re Erkrankungen sind Biomarker essenziell. Seit 10 Jahren forschen wir an neuartigen nicht-invasiven Tests. Dabei folgen wir dem Kernprinzip, viele Marker zu messen, um ihre Aussagekraft zu kombinieren und die Trefferquote zu erh\u00f6hen. Au\u00dferdem werden die Biomarker-Muster in verschiedenen Erkrankungen erhoben und verglichen, um krankheitsspezifische Muster zu finden. Als vielversprechendste Kandidaten werden microRNAs untersucht. Neben Microarrays werden Hochdurchsatz-Sequenzierung und qRT-PCR eingesetzt, um Patienten zu charakterisieren und statistisch auszuwerten. Neuartige genetische Tests Viele vererbte Erkrankungen werden mit Hilfe von Gendiagnostik erkannt. Hochdurchsatz-Sequenzierung bietet die M\u00f6glichkeit, viele Gene oder gar gesamte Genome von Patienten und ggf. Familienangeh\u00f6rigen zu entschl\u00fcsseln. Eine Kernherausforderung ist die Entwicklung von standardisierter Software, die in klinischem Kontext eingesetzt werden kann, um \u00c4rzte in der Diagnosestellung zu unterst\u00fctzen. Gemeinsam mit anderen Arbeitsgruppen forschen wir an geeigneten L\u00f6sungen. Das wohl bekannteste Beispiel eines Gesamt-Genoms, das in der Arbeitsgruppe ausgewertet wurde, war das Genom des 5300 Jahre alten \u00d6tzis. Test auf bakterielle Resistenzen Zur Auswahl der richtigen Therapie bei bakteriellen Infektionen ist es nicht nur wichtig, den Erreger der Infektion, sondern auch dessen Resistenzen gegen Antibiotika zu kennen. Klassische Resistenztests dauern bis zu 3 Tage, in dieser Zeit wird oft falsch therapiert. \u00dcberm\u00e4\u00dfige Gabe von Antibiotika f\u00fchrt zudem zu mehr multi-resistenten Bakterien. Gemeinsam mit Siemens Healthcare erforschen wir genetische Ursachen der Antibiotika-Resistenz. Ziel ist ein Schnelltest, der innerhalb eines Tages Bakterien und Resistenzen erkennt, um so schneller die richtige Therapie zu w\u00e4hlen. Die gewonnenen Erkenntnisse k\u00f6nnen dann eingesetzt werden, um gezielt neue Wirkstoffe zu erforschen. System-Biologie Um pathogene Prozesse besser zu verstehen, ist es wichtig, ein Verst\u00e4ndnis \u00fcber mehrere Komplexit\u00e4tsebenen hinweg zu erlangen. Dazu z\u00e4hlen molekulare Erkenntnisse (die klassischen &#8220;omics&#8221;, wie zum Beispiel Genomics, Proteomics, Epigenomics, miRNOmics, Transcriptomics, Metabolomics), Informationen \u00fcber Zellen (Beispiel histologische Untersuchungen bei Krebs), sowie Daten aus bildgebenden Verfahren wie Ultraschall oder Magnet-Resonanz-Tomographie. Wir befassen uns haupts\u00e4chlich mit der Integration verschiedener molekularer Daten. Dar\u00fcber hinaus arbeiten wir an ersten L\u00f6sungen, die die entsprechenden genetischen Profile mit klassischen bildgebenden Verfahren kombinieren. Ein Kernprojekt ist das Tool GeneTrail2, eines der umfangreichsten Bioinformatik-Werkzeuge zur Analyse von verschiedenen &#8220;omics&#8221;-Datens\u00e4tzen, das wir gemeinsam mit der AG Lenhof entwickeln<\/p>\n","protected":false},"author":5,"featured_media":0,"parent":3988,"menu_order":67,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"wf_page_folders":[214],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/3790"}],"collection":[{"href":"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-json\/wp\/v2\/users\/5"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=3790"}],"version-history":[{"count":19,"href":"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/3790\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":6243,"href":"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/3790\/revisions\/6243"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/3988"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=3790"}],"wp:term":[{"taxonomy":"wf_page_folders","embeddable":true,"href":"https:\/\/zbi-dev.cs.uni-saarland.de\/wp-json\/wp\/v2\/wf_page_folders?post=3790"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}