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On Wednesday, January 18, 2017,  Prof. Dr. Jean-Philippe Vert (PSL Research University, MINES ParisTech, Institut Curie, Paris) will give a talk in the context of the CBI Distinguished Speaker Series. The talk is entitled "Machine learning for patient stratification from genomic data" and will be held in Room 001, CBI (Building E 2.1) at 17:00 (sharp).

On Wednesday, December 14, 2016,   Dr. Jan Korbel (EMBL, European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg) will give a talk in the context of the CBI Distinguished Speaker Series. The talk is entitled "From mining genomics variations to molecular mechanisms" and will be held in Room 001, CBI (Building E 2.1) at 17:00 (sharp).

Mit bioinformatischen Methoden ist es Wissen­schaftlern aus Saarbrücken, Cambridge und Wien gelungen, Unterschiede in Blutstammzellen verschiedener Entwicklungsstufen zu finden und die epigenetischen Veränderungen während ihrer Differenzierung zu beschreiben. Dank neuartiger Sequenzierungs-Technologie konnten die Epigenome aus nur wenigen oder sogar einzelnen Zellen kartiert werden. Mittels maschinellem Lernen wurde aus den Ergebnissen ein Modell menschlicher Blutdifferenzierung direkt aus der Methylierung der Zell-DNA gewonnen. Damit steht ein neuer bioinformatischer Ansatz bereit, um komplexe Differenzierungswege im Computer abzubilden.

Die Entschlüsselung des menschlichen Genoms wurde im Jahr 2001 gefeiert, seitdem sind Genomanalysen viel billiger und besser geworden. Dennoch weiß man wenig darüber, welche DNA-Sequenzen mit bestimmten Krankheiten zusammenhängen. In den Niederlanden wurden jetzt in einer nationalen Studie die Genome von 250 Familien untersucht, dabei kamen einige Milliarden Daten zusammen. Der Saarbrücker Bioinformatiker Tobias Marschall hat gemeinsam mit Forschern aus den Niederlanden diese riesige Datenmenge analysiert, um neue, wiederkehrende und auch fehlende Strukturen zu entdecken. Dabei stießen die Forscher auf ein bisher unbekanntes Gen, das man so bisher nur bei Affen gefunden hat.

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